Kristian Jeppesen var oprindelig uddannet som arkitekt og blev mag.art. i klassisk arkæologi i 1951, og i 1958 forsvarede han sin disputats ved Aarhus Universitet.
Samme år blev han udnævnt til professor i klassisk arkæologi ved Aarhus Universitet, og han fungerede som professor i faget frem til 1991.
I et erindringsinterview, som Universitetshistorisk Udvalg foretog med Kristian Jeppesen i hjemmet på Lindevangsvej i Risskov i 1992, fortalte han blandt meget andet om sin disputats og forsvaret for den i 1958 og om Institut for Klassisk Arkæologis opståen i 1965 samt om tilblivelseshistorien bag de lokaler under Solgården, som Klassisk Arkæologisk Studiesamling (i 1986 omdøbt til Antikmuseet) har benyttet siden 1970.