Rudi Thomsen begyndte at studere historie, latin og græsk kultur ved Aarhus Universitet i 1936 og blev cand.mag. i 1944. Tre år senere forsvarede han sin disputats - også ved Aarhus Universitet - og i 1957 blev han ansat som professor i historie samme sted. Han gik på pension i 1986, men kom stadig dagligt på sit kontor og affattede en del bogmanuskripter også i den periode.
Da Universitetshistorisk Udvalg indledte sit oral history-projekt, var Rudi Thomsen den første, der gav et universitetshistorisk interview. Det var i august 1987.
I interviewet fortalte Rudi Thomsen bl.a. om sin lærer Johan Plesner (1896-1938), der var docent i historie ved Aarhus Universitet, da Rudi Thomsen indledte sit studium i 1936.
